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Analisis filogenetico de las variantes del virus SARS CoV 2 (Phyologenetic analysis of covid variants) scripts written in R language

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Ineso1/Analisis-Virus-SARS-CoV-2

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Analisis-Virus-SARS-CoV-2

Analisis filogenetico de las variantes del virus SARS CoV 2 El repositorio contiene investigacion y el proceso para entender y obtener un arbol filogenetico escrito en lenguaje R Se analiza el ADN de diferentess variantes de SARS CoV 2 y obtener las similitudes entre variantes para detectar ancestros en comun de las distintas variantes del virus

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En diciembre de 2019 se reportó la aparición del más reciente de los coronavirus que infectan humanos el SARS-CoV-2, en Wuhan, China. Causante de la pandemia en 2020 Durante la pandemia se han conocido diferentes variantes del virus, alguna de ellas: *Variante Alfa (Identificada por primera vez en Kent, Reino Unido) *Variante Beta (Identificadaq en sudafrica) *Variante Gamma (Conocida como variante brasileña) *Variante Delta (Identificada en India) *Variente Eta (primeros casos de esta variante en Reino Unido y Nigeria) *Variante IOTA (Identificada en la ciudad de Nueva York) *Variante Kappa (documentada en la India) *Variante Lambda (detectada por primera vez en Perú)

  • Contiene los scripts en R, pdf y html

Imagenes de contenido

#Visualizacion de alineamiento de secuencias ADN

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#Matriz de distancia

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#Arbol filogenetico

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Funcion Orientacion de nucleotidos pylogenetics render

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